Le chakra est la fusion de deux énergies. L'énergie corporelle qui s'acquit naturellement et l'énergie spirituelle qui s'acquit grâce à l'entraînement. On l'utilise pour effectuer des jutsus. Pour effectuer un une technique de ninjutsu, il faut composer des signes pour malaxer son chakra et mettre la bonne dose de chakra nécessaire au bon fonctionnement de la technique. Le systéme de circulation est comparable au systéme de circulation sanguine. Il est directement relié aux organes donc si on croise un Hyuugâ et qu'il nous touche un tenkentsu, on sera également touché aux organes.

Les tenkentsus sont les points du corps d'où l'on peut faire sortir le chakra. Il y en a 361. Pour utiliser un jutsu autre que le ninjutsu, on a pas besoin de malaxer son chakra mais on en consomme quand même.

Le chakra violet est une fusion des chakras bleu et vert et appartient à Orochimaru.